O piloto da Ducati MotoGP, Enea Bastianini, garantiu a primeira posição no grid para o Grande Prêmio de Portugal em uma emocionante sessão de classificação em Portimão. Bastianini, que tem enfrentado dificuldades com o ritmo de corrida nesse circuito, surpreendeu a todos com sua excepcional performance em uma única volta, conquistando sua segunda pole position na carreira. Essa conquista é especialmente significativa para Bastianini, já que no ano passado ele sofreu uma lesão que encerrou sua temporada em um acidente com Luca Marini nessa mesma pista. Maverick Vinales, da Aprilia, chegou agonizantemente perto de conquistar a pole position de Bastianini, ficando a apenas 0,082 segundos de distância. Apesar de lutar contra uma gastroenterite durante todo o fim de semana, Vinales foi o único piloto da Aprilia a avançar para o Q2. Jorge Martin, da Pramac Ducati, completou a primeira fila, com Pecco Bagnaia, seu rival pelo título de 2024, largando ao seu lado. Jack Miller, anteriormente da Ducati e agora pilotando pela KTM, e Marco Bezzecchi, da VR46 Ducati, se juntarão a eles na segunda fila. Pedro Acosta, um novato, impressionou ao avançar do Q1 e garantir a sétima posição no grid, apenas 0,009 segundos à frente de Marc Marquez. Infelizmente, as chances de Marquez conquistar a pole position foram frustradas por uma queda na curva 15 durante sua primeira volta. Foi um resultado decepcionante para Marquez, que havia mostrado grande potencial ao longo do fim de semana. Fabio Quartararo liderou os fabricantes japoneses em nono lugar, seguido de perto por Brad Binder, da KTM, e Alex Rins, da Yamaha. Alex Marquez completou os 12 primeiros no Q2, embora não tenha conseguido estabelecer um tempo competitivo. Aleix Espargaro, da Aprilia, foi o mais rápido entre os pilotos eliminados no Q1, mas ainda ficou a mais de dois décimos de segundo de avançar. Ele largará na quinta fila ao lado de Fabio Di Giannantonio, da VR46 Ducati, e Miguel Oliveira, da RNF Aprilia, o herói da casa. A Honda teve um desempenho lamentável nessa pista, que se esperava ser mais adequada para suas motos do que o circuito anterior. Johann Zarco, da LCR, foi o melhor piloto da Honda, batendo por pouco Joan Mir da equipe de fábrica. No entanto, ambos os pilotos ficaram a mais de nove décimos de segundo de avançar para o Q2. O único piloto da Honda com uma posição um pouco competitiva foi Augusto Fernandez, da Tech3 Gas Gas, que se classificou em 19º lugar.
